به گزارش «شیعه نیوز»، با پیوستن قرقیزستان به روسیه تزاری، عقاید مسیحی نظیر مسیحیت ارتدکس روسی، مذهب کاتولیک و لوتران( از شاخه‌های مسیحیت) در این کشور گسترش یافت.
در اوایل دهه ۱۹۹۰، ۲۹ کلیسا و معبد وابسته به کلیسای ارتدکس روسی حوزه اسقفی مسکو فعالیت داشتند.مهاجرت تعداد زیادی از مسیحیان روسیه مرکزی به شهرهای نوساز و نیز روستاها باعث رشد جمعیت مسیحی در این کشور شد. عمده پیروان مسیحیت روس‌ها بودند.
قبل از فروپاشی اتحاد جماهیر شوروی، مسیحیت در قرقیزستان و سراسر شوروی تحت فشار و ممنوعیت قرار گرفت. بسیاری از کلیساها تعطیل و روحانیون مسیحی تبعید شدند.
امروزه ۱۱ گرایش مسیحی در قرقیزستان رواج دارد. بسیاری از مراکز و اتحادیه‌های دینی پروتستان از جمله اتحادیه کلیساهای مسیحیان انجیلی باپتیستی(باپتیست: شاخه‌ای از مسیحیت)، مرکز دینی شاهدان یهوه، جماعت انجیلی لوتران، جماعت‌های مسیحیان مشایخی، کلیسای گرایش کاریزماتیک، جامعه دینی کتاب مقدس، نمایندگی‌های مراکز دینی خارجی و ... در ساختار خود چند کلیسا، خانه عبادت و مراکز دینی در سراسر قرقیزستان دارند.
آمار دقیقی درباره تعداد پیروان ادیان و مذاهب رایج در قرقیزستان در دست نیست، ولی براساس تحقیقات اولیه، بیش از ۸۰ درصد جمعیت قرقیزستان خود را مسلمان و بقیه افراد، خود را پیرو سایر ادیان می‌دانند؛ البته در این تحقیقات تعداد افرادی که پیرو هیچ کدام از ادیان نیستند، لحاظ نشده است.
وضعیت مراکز مسیحی در قرقیزستان در مقایسه با سایر کشورهای آسیای مرکزی آزادتر است، ولی روندی به سوی کاهش آزادی‌های دینی در این کشور مشاهده می‌شود. این روند بیشتر درباره گروه‌های دینی نوظهور، پروتستان و برخی نمایندگی‌های اسلامی صدق می‌کند.
اخیراً دولت به نمایندگی از کمیسیون دولتی امور ادیان قرقیزستان، اقدامات مشترکی با گروه‌های دینی انجام داده است. در سال ۲۰۱۶ صورتجلسه توافقنامه تأسیس شورای دولتی ادیان وابسته به کمیسیون امور ادیان قرقیزستان امضا شد. برخلاف این اقدامات، همه گروه‌ها در شکل‌دهی سیاست‌های دینی این کشور مشارکت ندارند.
بیشتر اداره مفتیات مسلمانان و کلیسای ارتدکس روسی برای همکاری با مراجع دولتی در حوزه سیاست‌های دینی جذب می‌شوند، اما سایر گروه‌های دینی برای این همکاری دعوت نمی‌شوند. در شورای دولتی ادیان، اعضای مفتیات، کلیسای ارتدکس روسی، جامعه دینی یهودیان و جامعه پیروان آئین بودایی حضور دارند، ولی نمایندگان گروه‌های پروتستان در این شورا عضویت ندارند.
در فوریه ۲۰۱۴ نشست شورای دفاع قرقیزستان با دستور رئیس‌جمهور به منظور بررسی چالش‌های موجود در حوزه ادیان برگزار شد. اروزبیک ملداعلی‌اف، رئیس وقت کمیسیون دولتی ادیان قرقیزستان در این نشست، مهمترین مشکلات این حوزه را فعالیت گروه‌های افراطی و فرق مخرب دانست که از جمله آنها، سازمان‌های کاذب ارتدکس روسی، پروتستان‌ها، باپتیست‌ها و شاهدان یهوه بودند.
