«شیعه نیوز»: متن پيام به اين شرح است:
بسم الله الرحمن الرحيم
انالله و انا اليه راجعون
رحلت فقيه مجاهد و پارسا حضرت آيت الله آقاي حاج ميرزا علي مشکيني اعلي الله مقامه موجب تأسف و تأثر شديد اينجانب گرديد. اين روحاني عاليقدر از جمله ي شخصيت هاي نادري بود که در سراسر عمر با برکت و در مراحل گوناگون زندگي نوراني خويش منشأ برکات فراوان براي حوزه ي علميه و مردم مؤمن و اسوه ي اخلاقي و عملي براي شاگردان و ارادتمندان خود بود.
در دوران طاغوت جزو پيشگامان نهضت اسلامي و در دوران جمهوري اسلامي در شمار مجاهدان واقعي و معلم اخلاص و پرهيزگاري و پارسائي محسوب مي گشت. رفتار و عمل او بيش از بيان شيرين و رسايش، دعوت کننده ي به ايمان و پارسائي و حق طلبي و حقگوئي بود.
جايگاه رفيع او در نظام جمهوري اسلامي و رياست مجلس خبرگان رهبري از آغاز تشکيل اين مجلس که نشانه ي حرمت و مکانت او در چشم نخبگان و علماي بزرگ و اساتيد مبرّز روحاني کشور است، هرگز نتوانست در تواضع و فروتني او يا در زندگي زاهدانه و دامن پاک او کمترين خدشه ئي وارد آورد.
او جامع علم و عمل، و جهاد و زُهد، و تشخيص و سلوک صائب و مستقيم و بدون انحراف بود. فقدان اين عالم رباني و اين روحاني جليل القدر، ضايعه ئي بزرگ است. از خداوند متعال علوّ درجات و مغفرت و رحمت واسعه اش را براي روح مطهر ايشان مسألت مي کنم و به ملت ايران و حوزه هاي علميه و مراجع عظام و علماي اعلام بويژه به خاندان مکرم و بازماندگان محترم و همه ي ارادتمندان و شاگردان ايشان تسليت عرض ميکنم.
والسلام عليه و رحمه اله و برکاته
سيدعلي خامنه اي
8 مرداد 1386