مدرسه مجتهدي يکي از مهمترين و بزرگترين مدارس جهت آموزش طلاب است. اين مدرسه که به رياست آيت الله مجتهدي فعاليت مي کرد، در حدود 54 سال پيش تاسيس شده است. اين مدرسه با فعاليتهاي شخصي آيت‌الله مجتهدي شکل گرفته که از جواني و به تشويق شيخ حسين زاهد مبادرت به تشکيل اين مدرسه کرده است. اين حوزه اندک اندک به شکل امروزي در آمده است.
بعد از فوت آيت‌الله مجتهدي، حجت‌الاسلام حبيبي طبق وصيت آيت‌الله مجتهدي جانشين ايشان شده است و مسئوليت مدرسه نيز به دکتر محمد مهدي نصيري سپرده شده است.
به گزارش شيعه نيوز به نقل از فردا، دکتر محمد مهدي نصيري اظهار داشت: فعاليتهاي مدرسه همانند گذشته و حتي گسترده‌تر برگزار مي شود. اين مدرسه به دليل قدمت، اساتيد قابل و همچنين توانايي بالاي مديريت آيت الله مجتهدي توانسته از جايگاه بسيار خوبي در اين سالها بر خوردار شود.
وي در رابطه با جانشين آيت الله مجتهدي گفت: به دليل اينکه موسس مدرسه خود حاج آقا مجتهدي بودند، علي القاعده خود ايشان تصميم‌گيري کردند. طبق وصيتشان آيت‌الله حبيبي را جانشين خود نمودند و البته اين تعارضي با مرکز حوزه علميه قم ندارد. همچنين امام جماعت اين مدرسه به آيت الله مير سجادي سپرده شده است.
وي در پايان گفت: اين مدرسه که تحت مديريت اين دانشمند فاضل آيت‌الله مجتهدي بود، از معتبرترين مدارس علميه تهران است و شاگردان عالم و وارسته‌اي از جمله استاد آيت‌الله خرازي، آيت‌الله استادي، حجت‌الاسلام کازروني (امام جمعه کرج)، حجت‌الاسلام ناصري (امام جمعه شهرکرد) و... را تحويل جامعه داده است.