روزنامه آفتاب یزد نوشت:
چندي پيش به دنبال اظهارات رحيمي معاون اول احمدي نژاد در حاشيه اجلاس سراسري نماز در خصوص كمك‌هاي دولت به حوزه علميه، مدير اين حوزه نسبت به اين موضوع واكنش نشان داد و بيان داشته بود كه <دولت كمك‌هايي براي تجهيز و تعمير مدارس داشته يا بيمه و امثال آن كه به همه شهروندان تعلق مي‌گيرد. حوزه مستقل است و روي پاي خود ايستاده و فقط توسط مقام رهبري و مراجع تقليد اداره مي‌شود.>
در همين حال ديروز مشاور روحانيت احمدي‌نژاد به توضيحات بيشتري در خصوص كمك دولت به حوزه‌هاي علميه پرداخت. ناصر سقاي بي‌ريـا مشـاور رئيس جمهــــور در امور روحــــــانيت در خصوص نظرات بزرگان در مورد تعامل دولت و حوزه‌هاي علميه و برخي شايعاتي كه در اين زمينه و براي مخدوش‌كـــردن روابط دولت و حوزه انجام مي‌شود، گفت: نظرات متفاوتي بين علماي بزرگ ما نسبت به كمك دولت به حوزه‌ها وجود دارد و در اين شكي نيست. برخي از بزرگان معتقدند كه دولت نبايد كاري با حوزه‌هاي علميه داشته باشد ولي برخي از بزرگان معتقدند كه دولت بايد حوزه‌هاي علميه را حمايت و پشتيباني كند.
به گزارش فارس، وي با بيان اينكه تعامل حوزه با دولت و نظام امري بديهي است، اظهار داشت: حوزه‌هاي علميه جزئي از نظام اسلامي ماست كه با يكديگر تعامل دارند و قبل از دولت نهم هم كمك‌هاي بودجه اي نسبت به حوزه وجود داشت ولي بسيار محدود بود، از آن گذشته در قانون اساسي نسبت به مراكز آموزش عالي، تكاليفي براي دولت ديده شده است و دولت مكلف به پشتيباني از مراكز آموزش عالي است.
مشاور رئيس جمهور در امور روحانيت ادامه داد: اگر ما حوزه‌هاي علميه را جزء آموزش عالي بدانيم كه قاعدتا و يقينا اينگونه است مدارج حوزه‌هاي علميه برابر با مدارج علمي آموزشگاه‌هاي عالي كشور و پذيرفته شده است و لذا دولت نسبت به حوزه‌هاي علميه تكليف دارد و بايد تكاليف خودش را انجام دهد.
سقاي بي‌ريا با تاكيد براينكه شوراي عالي حوزه هم از دولت مي‌خواهد كه پشتيباني‌هاي خودش را از حوزه داشته باشد، تصريح كرد: كمك به حوزه قبل از دولت نهم آغاز شد و مركز خدماتي حوزه‌هاي علميه و شوراي عالي حوزه در بودجه سهمي دارند و در دولت نهم يك بودجهاي براي كارهاي عمراني حوزه‌ها قرار داده شده است.
وي تاكيد كرد: دولت نهم رديف بـودجـــــه حــــــوزه را بــــــالا بــــــرد و اين قولي بــــــود كـــــه احمــدي‌نــــژاد در ملاقات‌ها با بزرگان حوزه داده بود و اين كار انجام شده است. مشاور رئيس‌جمهور در امور روحانيت در پاسخ به اين سوال كه <ميزان كمك‌هاي دولت به حوزه درچه اندازه و با چه هدفي بوده است؟> گفت: ميزان بودجه حوزه‌ها بارها گفته شده است. مايل نيستيم خيلي به اين اعداد و ارقام اشاره كنيم؛ چرا كه ممكن است برخي‌ها تلقي كنند كه دولت منت بر سر حوزه‌ها مي‌گذارد، در حالي كه اينگونه نيست و دولت وظيفه خود را انجام مي‌دهد و هنـــــوز مــا بـــــه مرحلـه لازم هم نرسيــــده‌ايـــم.
سقاي بي‌ريا افزود: سال‌هاي سال عمران و رسيدگي به حوزه‌هاي علميه مورد غفلت بــــــوده و دولـــــت نهم بحمـدالله حركت خوبـي را آغاز كــــرده و كمك‌هايي كه در دولت نهم به حوزه‌ها شده بي سابقه است.
وي هدف از كمك دولت به حوزه‌ها را انجام وظيفــــه دانست و خاطرنشان كـرد: كمك‌هاي دولت بـه حوزه‌ها مثل بودجهاي است كه براي دانشگاه‌هـا و دستگاه‌هاي ديگر در نظر گرفته مي‌شود. بالاخره نظام اسلامي است و بخش‌هاي مختلف بايد اداره شود و رشد كند.