به گزارش "شیعه نیوز" به نقل از ابنا، اين آتش‌سوزي حدود ساعت 1:30 دقیقه بامداد 20 آبان در يكي از اتاق‌هاي زيرزمين ساختمان قدیم اين مدرسه (موسوم به "ساختمان حاج آقا بزرگ) روي داد.
اگرچه با اقدام بموقع طلاب و حضور مأموران آتش‌نشانی، حادثه مهار شد و خوشبختانه به کسی آسیب نرسيد ولی كليه اقلام موجود در اتاق مذكور و حتي دیوار سالن مجاور در ْآتش سوخت.
اما مأموران پس از اطفاء حريق، متوجه کتابی می شوند که در این آتش سوزی به جز سوختگی کمی از جلد، سالم مانده اند و کوچک‌ترین آسیبی به محتوا و صفحات داخلي آن نرسیده بود. این کتاب چيزي نبود جز کلام الله مجید، قرآن.
مسؤولان مدرسه ابتدا احتمال می‌دهند كه شاید شدت آتش، کم بوده و باعث سوختن قرآن نشده است اما مأموران آتش‌نشانی اعتراف به معجزه بودن داشته، اعلام مي‌كنند شدت حريق به حدي بوده است كه به طور طبیعی این کتاب هم باید می‌سوخت.
شايان ذكر است حوزه علميه "جامعة امیر المؤمنین(ع)" در بزرگراه آزادگان تهران، داخل مسجد ولی الله اعظم (مسجد مادر سابق) قرار دارد.